愛蘇格蘭牧羊犬的耳道，很容易聚集一些油脂、水分和灰塵，尤其是大耳朵的犬，下垂的耳殼常常把耳道給蓋住，或者是耳道邊上的長毛（比如北京犬、貴婦犬等）都可以把耳道給遮蓋住，這樣的話耳道因為空氣的流通不暢，就容易聚集污垢、潮濕從而使耳道感染并發炎。所以，要常常檢查愛犬的耳道，一旦發現愛犬經常抓搔耳朵，或者是不停的用力搖頭擺耳，就證明愛犬的耳道有問題了，這就應該及時并仔細地給它檢查。
清除耳垢方法是：可以先用酒精棉球把外耳道消毒，然后在耳垢處滴3%的碳酸氫鈉滴耳液或者是2%的硼酸水，等到干涸的耳垢軟化了之后，再用小鑷子輕輕的取出來，鑷子一定不要插的太深，而且精力要高度集中，一旦犬搖晃頭部，就要馬上把鑷子拿出來，以防刺傷鼓膜或者是刺破耳道粘膜。對于有炎癥的耳道，可以用2.5%的氯霉素甘油滴耳液、4%的硼酸甘油滴耳液、可的松新霉素滴耳液等滴耳朵，一天滴3次。另外，還應該定期修剪耳道附近的長毛，在洗澡時一定要防止洗發劑和水濺入耳道。
