外部建筑一切準備就緒之后，就面臨要飼養的犬只的選擇問題。
對于一個致力于繁殖事業的犬舍來說，一只成熟的德國牧羊公犬在育種上是不可或缺的，有品質優良的種公犬才能培育出符合標準定的下一代，但是切記，種母犬才是你的資本，有好的種母犬，才能培育出屬于自己犬舍的幼犬。
因考慮到血緣形態的問題，大部分國家和地區都會進口種犬。目前，世界牧羊犬協會的所有會員國都采用德國的品種。如果要進口種犬，有些事項需要格外注意。例如，如果直接從德國進口，最好直接和育種者接洽，不要通過中間商。所有犬齡超過2歲的德國牧羊犬，都應該做過登記，各項證明證書齊全，幾個月大的犬，也都應有血統證書，另外還需要特別注意幼犬的父母犬是否都有血統證明。德國牧羊犬協會的會刊上會有已登記的純種狗記錄，應多加關注。
