臨床上主要是對癥治療配合高免血清和單克隆抗體治療(針對早期病情較為輕，單克隆抗體效果高于高免血清)。成犬治愈率高于幼犬，串種犬治愈率高于血統犬(血統犬大多為近親交配所得，免疫力低下)，幼犬預后謹慎。
在病發后嚴格控制飲食，禁食禁水，通過輸液等方式防止脫水。由于此時病犬腸胃功能紊亂，功能停止，喂食只能增加負擔，導致病情嚴重，口服葡萄糖和氯化鈉等方式無任何治療意義，切勿強灌。病犬在四十八小時內不再嘔吐腹瀉，可試探性喂食易消化食物，比如泡軟狗糧，小米湯。
止血常維生素K3、安絡血或止血敏;一般4~6小時一次，可同時或單獨應用。止吐常用愛茂爾、胃復安等。止瀉可用瀉痢停、藥用碳、腐敏、維迪康等。控制繼發感染可用抗菌類藥物，如青霉素、慶大霉素、氨芐青霉素、丁胺卡那霉素、硫酸小諾霉素、四環素和紅霉素等。強心主要用強爾心、樟腦磺酸鈉或安鈉咖等。
寵物醫院臨床上常用的處方為生理鹽水或5%~10%葡萄糖溶液20~50毫升/千克體重，氨芐青霉素5~10毫升/千克體重，強爾心0.5~2.0毫升/次，維生素C100毫升/千克體重，維生素K35~10毫升/千克體重，地塞米松2~5毫克/次，混合一次靜脈注射，每天1~2次，同時靜脈注射5%碳酸氫鈉注射液50毫升/千克體重，1~2次/天，愛茂爾1~4毫升，3~6次/天肌肉注射，維迪康0.2毫克/千克體重口服或灌腸，有較好的療效。
有飲欲的可給予足量的口服補液鹽溶液，自由飲用，沒有飲欲的可進行灌服，口服補液鹽溶液的配方為:氯化鈉3.5克，碳酸氫鈉2.5克，氯化鉀1.5克，葡萄糖20克，水1000毫升。為了補充營養，可靜脈注射25%~50%葡萄糖溶液、氨基酸或代血漿和白蛋白等。可大劑量應用地塞米松和山莨菪堿(654-2)溶液進行靜脈或肌肉注射。
為盡快排出腸道內容物，可進行灌腸。一般用0.05%~0.1%高錳酸鉀溶液進行灌腸，或者先用口服補液鹽溶液進行灌腸，最后再用口服液鹽溶液加抗菌藥或抗病毒藥進行保留灌腸，也可用生理鹽水、復方生理鹽水、乳酸林格爾氏液灌腸。
目前市場上有犬細小病毒病高免血清，可以試用。據資料報道，早期使用，并配合對癥治療，有較好的療效。但在其后期使用，意義不大。在治療時，也可試用犬用干擾素、犬用病毒靈(主要成分為干擾素、免疫球蛋白等)、嘔瀉寧、犬病一針靈、犬病康等。
補液量根據患病犬只的體重,脫水由輕微到嚴重一般按每公斤體重50-80毫升不等進行輸液。下面以體重10公斤的病犬為例,詳細介紹犬細小病毒的用藥情況:
注:(以下藥物為成組搭配，而非一次性將其全部混合)劑量以病犬10千克體重為標準，ml為毫升。
R:
乳酸鈉林格氏液150ml50%葡萄糖20ml維生素C 2ml維生素B6 1ml肌苷 2ml氯化鉀 2ml為一組靜脈注射;
0.9%生理鹽水100ml硫酸慶大霉素50000單位為一組靜脈注射;
5%葡萄糖氯化鈉100ml654-2(消旋山莨菪堿) 0.5ml雷尼替丁 0.5ml止血敏 2ml為一組靜脈注射,無論出血與否都加止血敏提前止血;
出血嚴重者:0.9%生理鹽水100ml人用止血藥立芷血1支為一組靜脈注射;
5%葡萄糖氯化鈉100ml注射用碳酸氫鈉 8ml為一組靜脈注射;
0.9%氯化鈉 100ml血漿 25ml為一組靜脈注射.
另:犬細小病毒止吐不能用胃復安,因為可以加重腸道出血,可用溴米那普魯卡因注射液或中藥注射用止吐靈;出血還可肌注維生素K1。
