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1、疫苗本身原因造成的免疫失敗：
(1) 疫苗有一定的有效期，過期的疫苗不能使用；在疫苗的存放和運輸過程中溫度高于4℃，疫苗也會失效。
(2) 疫苗質量不佳或疫苗稀釋液（蒸餾水和生理鹽水）質量不佳，也會影響免疫效果。
(3) 疫苗自身抗原含量不足。如：豬瘟細胞苗每頭份含毒量應不低于750RID（免體感染量），豬丹毒活苗每頭份含活菌不低于5億（G4T10株）。
(4) 疫苗中污染了其它病原微生物（尤其是活苗）。如：豬瘟兔化弱毒苗是用牛睪丸細胞生產的，培養過程一般需加小牛血清，如果加入的小牛血清中不慎污染了牛病毒性腹瀉病毒就會影響疫苗免疫效果，干擾或抑制抗體產生，所以豬瘟生產過程中間監測和成品檢驗都需對牛病毒性腹瀉病毒進行監測。
(5) 用強毒株生產的滅活疫苗滅活不徹底。
( 6) 免疫佐劑配置（選用）不當。
2、寵物本身原因造成的免疫失敗：
(1) 因供給寵物的營養嚴重不足或群眾水準過低，都會影響動物機體的免疫系統的完整性，而造成免疫功能低下。當寵物處在健康異常狀態時，如發病或久病剛恢復時，因身體的虛弱、機體免疫功能低下，很明顯，寵物機體的健康狀況越好對疫苗免疫應答就越好。另外，寵物的年齡、性別、應激等都影響寵物的免疫應答，個體之間的差別也是免疫效果出現不同的結果。
(2) 當寵物接種疫苗時，可能已經處于疾病的潛伏期，或存在嚴重的寄生蟲感染時，接種疫苗后必然導致寵物發病，從而導致免疫的失敗。
