蘇格蘭獵鹿犬的毛色有：深蘭灰色、淺不同的灰色、斑點色、黃色、沙紅色、紅褐色，首選的毛色為深蘭灰色，允許有白色的被毛，允許白色的毛發出現在胸前和腳趾，但前提是只限于深色的犬種。沒有白色的出現最為完美，但有部分優秀的品種在尾尖稍稍帶點白色。
蘇格蘭獵鹿犬若被毛為淺色則口吻為黑色，鼻鏡呈蘭色，且稍微有些彎曲。蘇格蘭獵鹿犬眼睛的顏色深，普遍為深褐色、褐色或榛色，眼圈呈黑色。蘇格蘭獵鹿犬在休息時，眼神顯得很柔和，興奮時，且充滿銳利的目光，視線非常遠。
蘇格蘭獵鹿犬的被毛為粗糙的剛毛，覆蓋于身軀、頸部以及四肢上，其長度為7.6～10厘米；頭部、胸部和腹部被柔軟的毛發所覆蓋。劉海位于前腿、后腿內側的地方，但不能形成象柯利犬那樣的“羽毛”。理想的被毛是濃厚、緊密、粗糙的，觸摸的感覺粗硬、干澀。
