圣伯納犬第一次發情一般是在8個月到一歲半之間,但是圣伯納犬第一次發情不適合交配,否則對圣伯納犬健康有很大影響,當半年后,圣伯納犬第二次發情就可以交配了,不過當圣伯納犬發情時,一定要照顧好母犬,主人可以給狗穿生理褲,防止未經選擇的雄性狗錯配,影響后代的質量。另外公狗不得外出尋找母狗,否則容易感染疾病或被其他公狗咬傷,因為爭奪配偶。

母圣伯納犬雖然每年可以繁殖兩胎,但生育過密,對母犬和仔犬的體質都有影響。根據母圣伯納犬的年齡和健康狀總可掌握兩年繁殖三胎或一年一胎比較適宜。超過9歲的母圣伯納犬一般不宜再繁殖。
雄性圣伯納犬不應頻繁交配,以免影響健康,縮短繁殖壽命。圣伯納犬交配一天一次,每3-4天應休息一天,偶爾一天內交配兩次,應相隔6小時以上,第二天必須休息。