一般來說，對于比較小的狗狗，如果比利時牧羊犬窩咳比較輕微的話，可能稍微的給其加強營養，好好休息一到兩周就可以自愈，但是在這個過程當中，可能還需要使用到抗生素預防繼發感染和用藥物緩解咳嗽的癥狀。
治療比利時牧羊犬窩咳還可通過霧化器使狗狗將藥物吸入呼吸道，治療效果比較明顯，但是在治療的過程當中需要注意不可刺激比利時牧羊犬的氣管，以免對氣管造成二次損害；在治療的過程當中，也最好將患病的比利時牧羊犬進行隔離治療，避免傳染給健康的比利時牧羊犬。
比利時牧羊犬窩咳主要通過空氣進行傳播，也可通過直接接觸進行傳播；此病雖然治愈率很高，但是會對比利時牧羊犬的健康造成一定的影響，對于六個月以下的比利時牧羊犬和免疫功能低下的可能更加容易感染和嚴重。
