迷你杜賓犬窩咳的治療需要標本兼治，一方面要控制咳嗽等癥狀，另一方面要殺滅病原體。需要注意的是，由于迷你杜賓犬窩咳往往由多種條件致病菌誘發咽喉炎癥，一般的藥物很難到達這個部位，大多數抗生素不能起到立竿見影的治療效果。
一些迷你杜賓犬主人因此使用大劑量的抗生素。但這個做法很不科學，長時間大劑量的抗生素會破壞迷你杜賓犬機體的免疫屏障，給病毒的入侵造成機會。
在初期，如果發現這種情況，可以給迷你杜賓犬喂一些抗病毒的口服液之類，另外要注意給迷你杜賓犬防寒。此外，別忘了定期給家里消消毒，給迷你杜賓犬一個清潔的環境！
