每年12月到翌年4月間是蝠鲼的繁殖季節。此時熱帶海域的水溫在26-29攝氏度間，蝠鲼開始成群出現在淺海區，通常是幾只體型較小的雄性一起尾隨在體型稍大的雌性身后，游速比平時略快。經過20-30分鐘的追逐后，雌蝠鲼逐漸放慢速度，雄蝠鲼則游到愛人身下，并用胸鰭“愛撫”其身體。完成短暫的交配后，雄性則揚長而去，接下來第二個追求者會重演以上的過程。不過，雌蝠鲼最多只接受兩個“意中人”的追求——1-2枚受精卵在雌性體內發育并孵化出仔魚，大約13個月后，小蝠鲼會直接從母體中產出，不久就能自由游動，獨闖天下了。小蝠鲼5歲時達到性成熟，適齡者便可延續自己的基因：它們的壽命約為20年。
種群分布
蝠鲼的英文名稱“manta”源于西班牙語，意為毯子，看看它的體型就知道了。又因其在海中優雅飄逸的游姿與夜空中飛行的蝙蝠相仿，故得此蝠鲼。第一次見到蝠鲼的人總會因它“異形”般的外表而不知所措，它很難令人將其與正統的魚類聯想到一起。其實，這種古老的魚類早在中生代侏羅紀時便出現在海洋中了。1億多年間，它們的體型幾乎沒有發生什么變化。從分類學上來說，蝠鲼和鯊魚的親緣關系最相近，同屬軟骨魚綱，單屬鲼形目蝠鲼科，現存3屬13種，遍布于南北緯35度之間的大西洋、太平洋和印度洋海域。在中國東部和南部海域能見到4種：雙吻前口蝠鲼、日本蝠鲼、臺灣蝠鲼和無刺蝠鲼。
蝠鲼主要棲居在熱帶和亞熱帶的淺海區域，較少停留或棲息在海底，從離海岸較近的表水層到120米深的海水中都能看見它們的身影。
中國福建、浙江和黃海一帶可見某些種類的蹤影。因為它們有洄游的習慣，所以在一個地方不會常年見到它們。每年6～7月在福建、浙江沿海，8～9月又到黃海。10～11月再回到浙江沿海，12月到來年2～3月沿原來路線洄游南下。
生物分類
鲼科蝠鲼屬(Mobula)與蝠鲼科前口蝠鲼屬(Manta)：
鲼科蝠鲼屬的九個物種：無刺蝠鲼(Mobula mobular)、褐背蝠鱝(又名臺灣蝠鲼)(Mobula tarapacana)、日本蝠鲼(Mobula japonica)、侏儒蝠鲼Mobula eregoodootenkee、下口蝠鲼Mobula hypostoma、庫氏蝠鲼Mobula kuhlii、芒基蝠鲼(Mobula munkiana、羅切氏蝠鲼Mobula rochebrunei、印度蝠鲼Mobula thurstoni
蝠鲼科前口蝠鲼屬(又稱鬼蝠屬)仍在研究，只發現過三種：雙吻前口蝠鲼(Manta birostris)(注：其中一種分類把前口蝠鲼屬編在蝠鲼科中，另一種分類把前口蝠鲼屬和蝠鲼屬都編在鲼科之中)、Manta ehrenbergii和Manta raya，而且這三種非常相似。因此有時，它會獨立成科，但大多數和鲼科的蝠鲼合并在一起。
物種保護
另外，亞洲地區部分居民有將蝠鲼腮作為藥用的習慣，他們認為蝠鲼的鰓耙(硬骨魚類每1個鰓弓的內緣生有兩排并列的骨質突起，稱為鰓耙。)擁有非常高的藥用價值，因此蝠鲼市價很高，這也是它被漁民大量捕殺的原因。但是截止目前，并沒有醫學研究證明蝠鲼腮是否有藥用價值。
2011年蝠鲼已被列入國際公約---保護遷徙野生動物物種公約(CMS)
國際自然生態保護聯盟(IUCN)已將蝠鲼歸類為"瀕危"物種。曼塔信托基金是一個總部位于英國的慈善機構，致力于蝠鲼的研究和保護工作。該組織的網站也提供蝠鲼保護和生物學的信息資源。
2013年《瀕危野生動植物種國際貿易公約》(CITES)將雙吻前口蝠鲼和阿式前口蝠鲼兩種前口蝠鲼作為瀕危野生動物列入公約附錄二。我國作為締約國，將從2014年9月14日起對以上兩種蝠鲼實施保護，對蝠鲼國際貿易進行監管。
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