動物學家研究表明：所有毛皮動物•，包括藏獒在內的色型基因等位符號為BB、CC、HH、KK、PP、丌、W、WW、ZZ等9對等位基因。因此，在藏獒繁殖提純復壯時，也離不開毛色等位基因符號。然而，在藏獒繁殖時只用人們喜歡的色型去繁殖我們需要的色型。如純白CC、VV、黑色ZZ、青色TT、淺黃Vv、鐵包金ZZ這6種色型。具體演變是由公、母犬的色型交配后所產的仔犬表現出來。
♦相同毛色正常文配
在配種時要注意掌握，防止出現雜色的色型。如紅配白、黑配白等雜色被毛。為使后代犬毛色純正、穩定，須用相同毛色的犬去進行交配，這樣可少繁殖出雜毛色的幼犬。如用黑色公獒去配純黑色母獒，用鐵包金公獒去配鐵包金母獒，用金公獒去配金母獒。
♦不同毛色改良文配
要想繁育出不同于種公犬或種母犬毛色的后代，在種犬毛色的搭配上一定要合適正確。否則，后代的毛色將花樣雜亂，無一點欣賞與商品的價值，更會因后代毛色雜亂，對藏獒今后的毛色鞏固帶來很不利的后果。
A.繁育金紅色或紅棕色
可用純正的公獒去配鐵包金的母犬，因母犬本身體內存在有黃、紅色素的基因，這樣相配可能會產出金紅色或紅棕色的后代。但所繁殖出來的紅毛后代，再次繁殖時，是不能去配那些也用此改良法產出的同毛色獒犬。因其紅色顯性基因不穩定，如果相配，結果可能出現紅毛稀少，黑毛偏重，或紅頭黑背紅腿或完全黑色的后代。
B.繁育白色
可用純白色的公犬去配草的母犬(或用純白色的母獒去配草的公犬)，這樣就能產出一些白色的幼仔，但幼仔大多會在頭頂、耳片上及尾巴中間帶有明顯的淺黃毛根。
C.繁育黑白相間的灰色
可用黃棕色的公獒(黃毛中夾有黑毛尖)去配純黑色的母獒(或用黃棕色的母獒去配黑色公獒)，這樣就可生出黑白混合的灰獒或淺黃帶有黑毛，整體上顯麻灰色的后代。
♦配種毛色上的擇優去劣
為了讓母犬所繁育出的后代毛色純正，在選種公獒時一定要搭配正確，不能用雙方都存在的同一缺陷犬去交配。這樣交配，會使父母犬共同存在的缺點完全表現在后代犬只上。以下就是一些常見的擇優淘劣選育方法：
a.尾巴尖白的母犬，用無此缺陷的公犬交配。
b.犬鼻梁有白斑的母犬，就用無此缺陷的公犬交配。
c.胸部白塊過大的犬，可選用無此缺點的犬交配。
d.雙腿有白毛的鐵包金母犬，可選腿無白毛的純正鐵包金公犬交配。
e.鐵包金犬的黃度較淺，就選用鐵包金紅色深的犬交配。
f.犬眼上方眉處2圓點無色或色淺，就選用圓點大和顏色亮的犬交配。
g.棕紅色的獒，是由毛色不相同的父母犬所產出的犬，故應選擇純的犬去交配。
h.母犬的被毛中黑毛尖略重，可用純正的公犬去交配。
i.鐵包金的公犬或母犬，全身毛色都純正，唯有犬的嘴巴唇腮兩側的黃度較淺，可選用嘴筒艷亮的犬去交配。
j.對黃頭、黑背、黃腿的犬，首選純正的鐵包金犬去交配。k.對青灰色的犬，可用鐵包金毛色的犬交配。
