水草
水草的生物性疾病的產生通常可以分成兩個階段，先由人、魚或其他蝦蟹軟體造成水草的外傷傷口，再由細菌作繼發性的感染。因此，在作細菌性疾病預防時，應避免水草運送、栽種時的人為疏失。同時，慎選同居的其他生物。
一、被水中魚類吃食
有些魚類在原產地即以水草為生，自然會對水族箱里的水草痛快下手。諸如：大型鉛筆魚、銀板、八字娃娃、泰國鯽、皇冠人間等等，皆應避免飼養在水草缸中。
二、被水中魚類挖掘
有一些魚類，像是大多數的非洲慈鯛、皇冠泥鰍等，雖然它們不會吃食水草，卻有挖掘洞穴的習性，其目的不外乎覓食、建立地盤與繁殖。在這些狀況下，受害最深的往往是水草的根部；輕微的可能只是整株水草浮起；嚴重的可能根被咬斷，甚至整株水草被連根拔起，應避免之。
三、被水中螺類吃食
螺類在水草水族箱中是除藻的重要幫手之一，但在某些狀況下會吃食水草，造成葉面的傷害并引發二次感染。因此，當水族箱出現這種危機時最好趕快把螺類移除。盡量不要用藥品毒殺，以免傷及無辜。
四、細菌性腐爛癥
水草葉片不出現萎黃化的現象，逕自變得透明并迅速溶蝕掉是細菌性腐爛癥的特證，感染速度極快。大多由新購入的水草開始發病。因為不當的輸送過程中所引起溫度的異常變化或是pH變化等，都是引發細菌性腐爛癥的原因。目前尚無治療此癥的特效藥，一旦發病時，可除去溶蝕的部份，并將水溫調整為大約 20-22°C的低溫以防止蔓延。若投入0.3-0.5ppm的硫酸銅進行殺菌或可降低病情之惡化。
五、水羊齒病
造成水羊齒病的細菌似是具有專一性。除了水羊齒以外別的水草并不會受到此類細菌的感染而病發。此病癥往往是在持續30°C以上的高溫或高pH值等不適水草生長的環境下發生。病證的出現，剛開始是水羊齒的葉部漸漸變成褐色半透明狀，最后終至枯萎。除了將受感染的葉片切除，并將水溫調低來防止蔓延外，目前尚無其他較有效的治療方法
