據報道，在東寨港紅樹林中生存著很多“底棲動物”，這些動物平時生活在灘涂及水體底部，是紅樹林生態系統中的重要組成部分，也是自然界重要的組成部分，這些“底棲動物”給紅樹林增添了另一份美。
東寨港為鳥類提供了鮮美的食物。
專家介紹，大型底棲動物是紅樹林生態系統中的重要組成部分，同時也是該系統物質循環、能力流傳中積極的消費者和轉移者。據調查，東寨港紅樹林底棲動物主要有軟體動物、環節動物、星蟲動物、節肢動物、魚類等。
一只在東寨港獵食魚兒的鷺鳥。
2009年3月-12月，海南大學專家對海南東寨港紅樹林區大型底棲動物的調查和研究。于當年的3月、6月、9月和12月分別代表春、夏、秋、冬四季，每季度調查一次。此次調查發現東寨港紅樹林濕地的大型底棲動物平均生物量和棲息密度較高，分別為239.24g/㎡和642.92ind/㎡。
軟體動物是東寨港底棲動物主要群類。現已調查記錄到的軟體動物115種，主要有萊彩螺、紫游螺、斑肋濱螺、黑口濱螺、粗糙濱螺、紅樹蜆、棒錐螺、瘤背石磺、毛蚶、泥蚶、海月、近江牡蠣、僧帽牡蠣、團聚牡蠣、胖紫蛤、縊蟶、長竹蟶、文蛤、紅肉河藍蛤和珠帶擬蟹螺等。