母犬的生殖系統由卵巢、輸卵管、子宮、陰道、尿生殖前庭和陰門組成。它的主要功能是產生卵子和雌激素，并在適當的時候由卵巢釋放卵子，當排卵期來臨時有發情表現。
卵巢呈長而稍扁的橢圓形，完全包圍于卵巢囊內，囊的腹側面有一裂口接輸卵管。表面凹凸不平，內有處于不同發育時期的卵泡，包括原始卵泡、生長卵泡和成熟卵泡。成熟卵泡在發情后3～4天成熟并破裂排卵，屬自發排卵。排卵后，破裂的卵泡轉為血體，然后變為共黃體。如果未妊娠，為假妊娠黃體，經一定時間而退化。如果妊娠，為妊娠黃體，持續到妊娠中期才慢慢退化。退化黃體被周圍結締組織伸入形成白體。黃體可分泌孕酮，使母犬生殖系統安靜，利于妊娠。在卵巢內也有一些退化卵泡、卵閉鎖卵泡，其內膜細胞可轉化成間質腺細胞，能分泌雌激素。
輸卵管是一較短的彎曲的細管，平均長度約5～8厘米。前端接卵巢囊，后端接子宮角，是精子和卵子受精和卵裂的部位。
母犬的子宮屬雙角子宮，分為子宮角、子宮體和子宮頸。子宮角細長而直，長約12～15厘米，胎兒在此生長、發育和成熟。子宮體短，長約2～3厘米。子宮頸很短，有一層厚的肌層，后連陰道。子宮借子宮闊韌帶附著于腰下部和骨盆腔側壁，位于骨盆腔入口處，在直腸和膀胱之間。子宮的形態和結構因發情周期及妊娠而有變化。在發情前期，特別是受精后，子宮內膜發生明顯變化，以迎接胚胎著床，并進而形成胎盤，保護胎兒過了一段時間后，腹壁肌強烈收縮，子宮頸張開，將發育成熟的胎兒和胎衣分娩出。
犬的產道是陰道、尿生殖前庭和陰門，同時也是它的交配器官。尿生殖前庭黏膜內有前庭小腺，腹側壁有尿道開口。陰門由左右陰唇構成，陰蒂發達。在性欲期，前庭腺功能加強發情。
母犬6月齡開始發情，到達性成熟后，每年發情2次，多在春、秋兩季。但配種不應早于18月齡。從上一個發情期開始到下一個發情期開始的過程稱為性周期，約126～240天，期間雌性個體生殖系統發生一系列變化，常分發情前期、發情期、發情后期和發情間期。發情期持續14～21天，母犬的外生殖器官腫脹，并有分泌物出現。一般在發情后第3天或第4天排卵，妊娠期約60天(58～63天)。
