出現錨頭蚤之后可以使用伊維菌素等藥物進行治療。但是一定要注意用量，如果太多的話，會影響魚群的身體健康。
一般魚蟹混養池使用阿維菌素、伊維菌素等藥物全池潑灑殺滅一些中華蚤、錨頭蚤、線蟲、蠕蟲等魚體寄生蟲，但經過長期使用，寄生蟲對其產生了很強的耐藥性，要想殺死它們必須不斷加大劑量，隨著用藥量的加大，對魚蟹等養殖動物自身產生了一定的傷害。
特別是，有些養殖戶使用敵百蟲來殺錨頭蚤，往往引起魚數天食欲減退，直接影響其正常生長。 錨頭蚤一般壽命14天左右，從產卵到孵化則為2天~3天，一般殺蟲藥只能殺死它的幼蟲，而不能殺死它的卵和成蟲。
針對上述情況，建議養殖戶在殺滅錨頭蚤的問題上不能心急，可通過檢查寄生在池魚身上的錨頭蚤蟲期，適時用藥，不要隨便加大藥量。如是老蟲，則不用藥，并在間隔5天~7天時根據復發情況決定是否再次用藥。
注意使用的藥物盡量不要太刺激，否則會傷及魚群。
