吉娃娃屬于小型犬種，因此它們也容易患上小型犬種常易出現的疾病，例如是膝蓋骨脫臼、牙周病、氣管塌陷等。
【1】氣管塌陷
如果吉娃娃最近一直發出類似咳嗽的聲音，但尾音會更高，有如鵝叫般，這可能是出現氣管塌陷。氣管塌陷癥狀，常發生在小型犬與短鼻犬種身上，無論是先天或后天，都有可能并發此癥。
【2】牙周病
狗狗和人類一樣，如果口腔不潔，便有機會出現牙周病，輕則替狗狗刷牙時易出血，嚴重的話牙齒會鬆動脫落。不只是吉娃娃會較易患上牙周病，許多小型犬種同樣易患上。這是因為我們在喂飼小型犬種時，多會給予較柔較軟的飼料，而且還經常給零食小狗。這些細小的食物，容易藏在牙縫里不易清理乾淨，結果食物殘渣和細菌滋生混合，造成口臭及牙周病。
【3】角膜炎
由于吉娃娃眼睛比較突出，而且一般喜歡跳躍，因此容易弄傷眼睛位置。角膜炎通常是由于異物入眼而造成，例如洗毛液沾了在眼睛附近位置未有沖洗干淨、眼睫毛跑進眼眼、經過草地時擦傷眼部，分泌物積累沒有好好清潔等。另外，如果與其他狗狗打架或被異物刮損眼角膜，亦會引致角膜炎，造成眼睛畏光、充血及紅腫等情況。
【4】水腦癥
水腦癥是指頭蓋骨中，腦室里腦脊髓液過度蓄積，從而壓迫到腦部的疾病。由于大腦被過多腦脊髓液壓迫著，令肢體操控易產生障礙。許多吉娃娃都有這個先天的問題，而如果腦部曾受創傷，也可能出現水腦癥。
【5】膝蓋骨脫臼
同樣是先天問題，膝蓋骨脫臼常出現在吉娃娃身上。膝蓋骨脫臼癥狀可分4個等級：
「等級1至2」：膝關節雖然有不穩定的情況，但不太容易察覺出異常，就算是脫臼，也可輕易自行回復，狗狗沒有明顯痛楚表現，因此常被忽略。
「等級3至4」：吉娃娃會有異常舉動，例如走路時突然后縮起后腿、踢腿、走路一跛一跛等。問題更嚴重時，會出現沒法正常走路，走路時出現痛楚樣子，或不愿走路等情況。
