青海田鼠體形中等，耳小，尾短，爪強大。吻部短，耳小而圓，其長不及后足長。尾長約為體長之1/4左右。四肢粗短，爪較強大，適應于挖掘活動。
青海田鼠軀體背毛較長而柔軟。鼻端黑褐色。體背毛暗棕灰色，其毛基灰黑色，毛端棕黃色，并混雜有較多黑色長毛。腹面毛色灰黃，毛基灰黑色，毛端淡黃或土黃色。耳殼后基部具十分明顯的棕黃色斑。尾明顯二色，上面毛色同體背，下面為沙黃色，尾端具黑褐色毛束。前后足毛色同體背或稍暗，足掌及趾（指）為明顯的黑色。爪黑色或黑褐色。
青海田鼠頭骨較粗壯。上頜骨突出于鼻骨前端，鼻骨前端不甚擴大。眶間部顯著狹縮，左右眶上嵴緊相靠近至相互接觸。顴弓較粗壯。腭孔顯，較粗大，腭骨后緣有小骨橋與左右翼骨突相聯。
