青海田鼠對食物的選擇隨季節而變化。6月中旬以前喜食萎陵菜的根莖；6月中旬以后喜食苔草、嵩草、披堿草、針茅等植物的綠色部分。青海田鼠日食鮮草26~38g，約為體重的一半。
青海田鼠棲息于海拔3700-4800m的沼澤草甸地帶及高山草甸草原、高寒半荒漠草原帶，喜選擇疏叢型草地及灌叢草地等氣候溫和、土壤疏松、牧草比較豐茂、具有嵩草、萎陵菜、苔草、沙草的草地作為棲息位點。
青海田鼠具有較強的遷移習性，遷移距離可達數公里以外，故其棲居地不甚穩定。在其分布地帶，有效洞口的數量變動可相差幾十至幾百倍，這與其經常性的遷居有關。
