公魚和母魚的區別在于外部形態體型的區別還有與身體色澤的區別，以及手感與動感等方面都可以進行區分。
(一)外部形態的區別：
(1)體形的差別：雄性金魚一般體形略長，雌性金魚身體較短且圓。懷卵期雌魚較雄魚腹部膨大。
(2)尾柄的差別：雄魚比雌魚略粗壯。
(3)胸鰭的差別：細心觀察可發現，雄魚稍尖長，胸鰭第一根鰭刺較粗硬;雌魚呈短圓形，胸鰭第一根鰭刺不太硬。
(4)泄殖孔的差別：由肚皮向上看，雄魚泄殖孔小而狹長，呈凹形;雌魚泄殖孔大而略圓，向外凸。
(二)色澤的區別：雌雄不同的金魚，在體色上略有差異，雄魚一般顏色鮮艷，而雌魚略淡一些，在繁殖發育期，雄魚體色更為鮮艷。
(三)手感與動感：用手輕托魚的腹部，中指和無名指感觸到雄魚腹部有一條明顯的硬線，雌魚則腹部較軟。走過魚池邊時，猛踏腳觀察，雄魚游動速度快而且敏捷，雌魚動作則慢一些。
(四)追星：隨著氣溫的升高，金魚在產卵期會出現第二特征--追星，這是辨別金魚性別最容易、最準確的時候，也是最容易掌握的一種辨別方法。雄魚的追星出現在胸鰭第一根刺和鰓蓋邊緣，多時整個胸鰭每個鰭條上都長有追星，前端的明顯，后面的要仔細才可以觀察到。這種粗糙的小白點就是追星。
區分公魚和母魚要掌握方法才能夠有效的去區分。
