酋長短鯛的繁殖有點麻煩，它們的產卵量通常在40～60粒左右，但受精卵孵化率很低，一直是困擾成功繁殖的問題關健。
酋長短鯛產卵了，繁殖用水
(1)活性碳過濾水：將活性碳裝入塑料或搪瓷圓桶中，讓自來水從底部的進水口流入，從頂部的出水口流出。過濾后的水貯存在水族箱或其他容器中，既可作日常飼養用水，又可作普通熱帶魚的繁殖用水。
(2)離子交換樹脂過濾水：將離子交換樹脂作過濾材料，借助于陰陽離子交換樹脂的吸附能力，可將水中的鈣離子、鎂離子、亞硝酸鹽吸附。
(3)去離子水：又名蒸餾水。一般采用電滲析和電解法來獲得，水質非常純凈。去離子水的水質極軟，水中含氧量極低，不適宜作飼養用水。使用時，常采用與清潔水兌摻的方法，來獲得不同硬度和酸堿度的水質，滿足不同品種繁殖用水的需要。
(4)雨水：水質較軟，金屬離子含量很少，一般可選市郊地區空氣清新的地方，用容器盛裝雨落水，再經過濾后即可使用。
