治療黑神仙魚漲肚腸炎：護食不吃食，肚子微微的鼓著不排便，用一次性針管，和一次性點滴輸液器，去掉針頭。把軟管和一次性針管配成一套灌藥器，將“頭孢針劑”分出1/5，用存凈溫水(28~30度)花2ml藥水，“針管有刻度”。將黑神仙魚撈出將細軟管輕輕插到魚嘴里 “3~4cm”，每條魚灌0.5ml(魚10公分左右)，開始排便(透明的魚便)用同樣的方法在強灌藥一次，灌藥后觀查是否排白便，如果排便說明藥起了作用。什么時候不排白便了說明已經好了，可以回家靜養，但還不吃食這很正常不要擔心，慢慢就會吃食了。
黑神仙魚細菌性爛鰓病用呋喃西林治療。寄生蟲鰓病用高錳酸鉀、福爾馬林；食鹽等治療。棉口病又名爛嘴病。病魚口周圍吻部長著白色棉花狀菌絲如絨，也稱白嘴病。常用嘴觸舐箱壁攝食藻類魚易患此病，容易傳染。病魚難以攝食,游動緩慢無力,以致死亡。要及時治療處理。用青霉素或金霉素溶液，也可用10ppm土霉素溶液浸浴病魚。水族箱、撈魚網、工具等用0.1%甲醛溶液浸洗消毒。感冒水溫驟變，黑神仙魚突然遭到不能忍受的冷刺激而發病。
