在養殖大鱷龜的時候，合理挑選食物是一個重要的環節。大鱷龜是一種吃雜食的動物，能吃的食物種類比較多。大鱷龜的食物有：動物性餌料和植物性餌料兩大類。大鱷龜最喜歡肉類食物，尤其是活食，比如小魚、小蝦、泥鰍等等。還有新鮮的瘦肉和動物內臟大鱷龜也很喜歡吃。若是喂活食，最好先消消毒，然后切碎再喂。
雖然大鱷龜很喜歡吃肉類食物，但是，也要注意營養均衡，葷素結合喂食。大鱷龜的植物類食物也很多，蔬菜類如生菜、蘿卜等，谷物類如大米、水稻等，還有水果類如蘋果、香蕉等。另外，平時也可以喂一些龜飼料和狗糧。不過，要購買質量較好的飼料而且喂的時間不宜太長。飼養大鱷龜期間，喂食的頻率一定要把握好，因為喂食頻率是否得當直接影響大鱷龜的生長發育。
