在地圖龜屬內,區別雌雄還是比較容易的。就像大多數其他的龜類一樣,雄龜具有比雌龜更為粗長的尾部,并且其泄殖孔的位置超出背甲的后緣。雄龜的前足上長有加長的爪子。成年后的體型大小也可以成為鑒別特征。對大多數成龜來說,最小的雌龜也要等于甚或大于最大的雄龜。
大多數地圖龜背甲后部的緣盾也向后突出,使背甲的后緣呈現為明顯的鋸齒狀。有些種類具有巨大的頭部和顎部,這使得它們可以咬碎蝸牛和其他的軟體動物。末了,最引人注目的區別在于它們皮膚和盾片上的那些富有特色的細線,這正是“地圖龜”這個名字的由來,因為它們看來就像是地圖上的等高線和公路行車圖,這是其他龜類所難以企及的。