刀背麝香龜在溫度下降到15℃以下時就會自主進入冬眠，當溫度持續下降到10℃時就會完全進入冬眠，飼養期間需要將溫度控制在5℃左右，讓刀背麝香龜停留在深度冬眠中，并且隨時注意溫度的變化防止變溫。
刀背麝香龜冬天的時候，溫度在17~20度以下，食欲就會減退，到15度以下才會正式進入冬眠。刀背麝香龜冬眠的時候，可以將它放在水中，或椰土和沙子里進行冬眠。并且在刀背麝香龜冬眠期間，要放在溫度的穩定的環境中，并保持環境的潮濕。
當刀背麝香龜需要冬眠時，主人需要提前每年的9月份開始給它貼膘，堅持喂食一個月的高脂肪、高蛋白等營養價值高的食物，讓刀背麝香龜有足夠的脂肪熱量度過為期5個月左右的冬眠。另外，主人需要在刀背麝香龜冬眠前一周左右停止喂食，用溫水刺激刀背麝香龜食欲，并讓它停止進食，加快刀背麝香龜體內的新陳代謝清理腸胃，等刀背麝香龜自主進入冬眠，直到次年溫度回升后蘇醒。
