沼澤側頸龜可以深水養，水深0.3~0.5m。每天早晚巡池2次，查看水位，適時添加新鮮水，維持水質清新。通常每1~2個月排水2/3，然后重新注新水，水位保持0.5m左右。如果沼澤側頸龜白天長時間停留岸邊、反應遲緩等現象時，及時撈出。
沼澤側頸龜餌料可直接放入水中，以適應沼澤側頸龜喜歡在水下進食的習性。水溫20~24℃時每2~3天投喂食物1次，25℃以上時每天喂1次，低于20℃時不需投喂。每次投喂時間須基本固定，定時攝食有利于龜形成條件反射，也便于觀察龜的吃食情況。投喂量應根據季節、天氣、飼料質量、龜體大小等確定，一般為龜體體重的1~5%。食物以高蛋白配合飼料為主。
