凹甲陸龜常見寄生蟲病即阿米巴原蟲感染。病龜精神差，喜泡水或漂浮于水面，吃食廢絕，拉稀，糞便惡臭。病死龜解剖見消化道黏膜出血或潰瘍，亦有肝臟病變。治療辦法：芬苯達唑劑量：100毫克/千克，每周使用1次，連續2-3次：甲硝唑劑量：50毫克/千克，每天1次，連續使用3天，兩周后再重復；百病消片劑，口服，每天1次，2周為1個療程，使用2-3個療程。
凹甲陸龜紅眼病的病因通常是鼻腔內病菌感染引起，表現為鼻、臉及眼部紅腫，嚴重者影響動物采食和生長。治療方法：采用環丙沙星滴劑滴入鼻腔和眼部，1天2-3次，連續使用2-3周可治愈。
凹甲陸龜呼吸道疾病，治療采用百病消按5毫克/千克，1天1次或10毫克/千克2天1次給藥，對不能自主采食的病龜，要人工填食，以保證其體力，增強體質，從而增強機體的抗病能力。通常情況下，要3-4周可治愈。
