牟氏水龜會冬眠，當氣溫低于攝氏15度時，牟氏水龜就會鉆入土中冬眠。幼牟氏水龜不會冬眠，只會到2~3歲才冬眠。夏天如果氣溫超過30度，牟氏水龜也會進入夏眠狀態，需要注意夏天的降溫措施。
牟氏水龜的棲息地通常是沼澤淺灘和濕潤泥濘的草地，在春夏秋三個季節活動頻繁，冬季會在野外淤泥中冬眠，為了冬眠或者避免夏天的高溫、敵害，牟氏水龜通常會把自己深深的埋在泥塘的底部。基本飼養環境以箱龜的方式比較合適，牟氏水龜在水中活動的時間并不長，水澤區可以占飼養缸的2/5，陸地區占3/5。不過幼牟氏水龜比較傾向水棲，所以水澤區可以占到飼養缸的1/2。
