沼澤箱龜的健康狀況與飲食是分不開的，野生環境下沼澤箱龜會捕捉一些昆蟲等小動物，在人類飼養時也要提供給其一定的肉類食物，為了保證營養的均衡，也要提供蔬菜與水果。
沼澤箱龜可以挖掘地下的蚯蚓或枯木中的蟲類，蝸牛、毛蟲、甲蟲等為主食，也會吃果實、青草、漿果類、菌類及野花等植物類食物，主要是在陸地上覓食。而在人工環境下，要長期成功的飼養箱龜，就需要花較多時間去注意它們的進食狀況，并經常調整食物的內容。以達到營養均衡的要求。基本上沼澤箱龜食物中，動物性蛋白質如面包蟲、蟋蟀或蚯蚓等要占50%，也可以用沼澤箱龜飼料替代。
