紅紋錦龜雌雄辨別方法如下：
1、雌性紅紋錦龜背甲較短且寬，腹甲平坦中央無凹陷，尾細且短，尾基部細，泄殖孔距腹甲后緣較近，腹甲的2塊肛盾形成的缺刻較淺，缺刻角度較大。雄性紅紋錦龜背甲較長且窄，腹甲中央略微向內陷，尾粗且長，尾基部粗，泄殖孔距腹甲后緣較遠，腹甲的2塊肛盾形成的缺刻較深，缺刻角度較小。
2、將紅紋錦龜的腹甲朝上，左手的大拇指、食指二中指分別將紅紋錦龜的前肢、頭壓迫縮入殼內，右手將紅紋錦龜的尾擺直，若紅紋錦龜的泄殖腔孔內有黑色的陰莖伸出，則為雄性，若紅紋錦龜的泄殖腔孔排出泡泡或稀粘液，則為雌性。
