關于藏獒的祖先，存在著較大的爭議，原因是它無論是從形態還是外觀上，都與大多數數的狼和狗迥異，因此，許多人認為藏獒起源于某種遠古的大型獒類藏獒驢子的照片。但是，根據目前科學的研究發現，藏獒與其他的狗一樣，都是由狼馴化而來的。那么，藏獒經歷了怎樣的一個馴化過程才有了如今的形態呢？我們一起來探討一下這個問題。
藏獒的身世之謎藏獒的“身世”之所以存在一定的爭議，最關鍵的問題不是外觀，而是一個頭骨化石藏獒驢子的照片。在我國甘肅和政縣曾經出土過一個大型食肉動物的頭骨化石，而且還是完整的頭骨化石。根據科學家的測量與對比發現，該頭骨與現存的犬科動物有著較大差異，它比現存的犬科動物頭骨要寬，而且額骨突出，吻部更加的寬厚。因此，科學家們初步判斷，該頭骨化石并非犬科動物。
之后藏獒驢子的照片，有人提出了一個觀點：該頭骨化石很有可能是來自于藏獒的祖先。之后，這個消息就被許多人在網上大肆的宣揚，成為了藏獒不是狼馴化而來的直接證據。（如下圖）
但是藏獒驢子的照片，根據后來科學家們的研究，我們就會發現，上面那個說法早已經被推翻。首先，科學家根據對化石的分析得出，該動物生存的年代大約在距今約1000萬年前。其次，之后在和政縣又出土了一個與這個頭骨非常接近的動物頭骨化石，根據基因測序與對比發現，該頭骨確實與犬科沒有任何關系，因為這兩個頭骨均是一種動物巨鬣狗。
最關鍵的是藏獒驢子的照片，藏獒雖然從形態上看與狗和狼都有較大的差異，但是有一個東西，它騙不了人，那就是基因，藏獒與我國許多平原地區的狗有著非常接近的基因，也就是說，藏獒與其他的狗一樣，都是由狼馴化而來的，只不過，在演化上，藏獒與大多數的狗有一定的差異而已。（下圖為狗與狼的基因關系，圖片來源國家地理）
藏獒是如何產生的？雖然現代的狗都是狼馴化的“后代”，但是，現存的狗已經很少有狼直接馴化產生的了，這是因為狼的馴化發生在距今約1.5萬年前，當狼放棄了狼的身份，成為了狗之后，它們在不同的環境下形成了一定的差異性。從目前狗與狼的基因分析看，現存的狗基本上都是早期馴化的狗與狼雜交之后的產物，其中包括了馴化后的狗、徘徊在人類生活區附近的野生狼以及不同地區的狼和狗多次雜交。因此，不同的狗基因上存在一定的差異。
關于藏獒的產生，在以前有兩個說法：第一是說，藏獒是由早期的人類將馴化后的狗帶到了高原地區，這些狗與高原地區的狼發生基因交流，最后在低氧、高寒的環境下，它們慢慢的毛發變長形成的。
第二個說法是藏獒是由平原地區的狗在特殊的環境下（高原）慢慢的演化而來的。至于以上兩個說法，乍一看，第一個說法比較的有道理。但是，科學家們對青藏高原地區來自于8個族群的49只狗和野生狼進行了基因分析（4個狗的族群和4個狼的族群，比如青海灰狼、新疆灰狼等等），發現藏獒與來自于4個狗群的基因最為接近，反而與4個狼的族群的基因相差甚遠。而狗在人的長期馴化中，會慢慢的“拋棄”來自于野生灰狼的基因，原因是生活習性和環境的改變造成了基因差異。這也就意味著，藏獒在原產地并沒有發生與野生狼基因交流的事情，這也就推翻了第一個說法。
通過科學家的研究，藏獒來源于我國古代中原地區的狗的說法更加得到了鞏固（與同地區其他狗族群的基因相似性）。而且根據對藏獒的基因組分析，科學家們也發現，在藏獒的基因中有11個基因與適應性有關，其中包括了低氧適應遺傳基因，而這些基因均為變異的基因，其變異時間大約在1.1萬年前-4000年前之間。也就是說，藏獒的祖先狗是在這個時間跟隨當時的人類來到高原地區的，在低氧、高寒的環境下，一部分活下來的狗發生了適應性的基因變異，這讓它們嘗到了在惡劣環境下的生存的甜頭。慢慢的這些基因經過上千年，甚至一萬多年的累積慢慢的增大，變得越加明顯，最終形成了藏獒。
總結根據科學家們對藏獒基因的分析，以及現存高原地區狼與其他狗族群的基因分析發現，藏獒與高原地區的野生狼并沒有什么基因交流，反而與其他的狗有較高的基因相似性，因此，這些狗都是后來才來到高原地區的，而不是由高原地區的野生狼馴化而來的。
從平原地區到高原地區，環境的驟變，加速了藏獒祖先狗的變異，而那些有利于生存的變異就保留了下來，比如低氧適應、厚長毛發的基因等等，經過了至少4000年的適應和變異后，才最終形成了如今的藏獒。
