家養寵物兔主要有一下幾類疾病:兔球蟲病，胃腸道系統，皮膚，牙齒疾病寵物兔子。
兔球蟲病是由于感染球蟲寄生在腸道上或肝臟膽管內所引起的一種疾病。病兔消瘦寵物兔子、貧血、拉稀、腹脹。確診需要做糞便檢查，一旦發現球蟲卵，需要及時做驅蟲處理
兔螨病 是家兔中侵襲性極強的一種寄生蟲病寵物兔子，常見于兔的足、爪、鼻和外耳部等處。患兔出現劇烈癢痛、皮膚發炎甚至脫毛，由于奇癢難忍，到處摩擦、搔抓或啃咬，食欲不振，日漸消瘦。鏡檢一旦發現螨蟲，需要連續做體外驅蟲。
兔子脹氣:當兔子遭遇應激寵物兔子，粗纖維攝入不足等因素時，胃腸道蠕動會遲緩，積存的食物會在胃腸道內發酵產生大量的氣體，脹氣最初可能兔兔還在繼續進食，胃口看不出什么區別，但便便開始變小并干硬。發展到胃腸道停滯的狀態，會完全不吃不喝，精神萎靡，相當部分還會腹痛。若此時不采取措施，造成阻塞的食物和毛團等組成的團塊停滯在消化道中，消化道會吸收其中水分，導致脫水，腸道排空的速度變慢，有害的細菌就會大量繁殖，細菌繁衍所產生的有毒氣體開始破壞腸道，并使兔子非常疼痛。臨床上兔子胃脹氣死亡率還是很高的。
兔子的牙齒問題:1. 咬合不正: 寵物兔的牙齒跟嚙齒動物一樣寵物兔子，是無限生長的，所以寵物兔必須要進食粗纖維的較硬的食物，在咀嚼食物的過程中，將牙齒磨短，以保持合理的長度。牙齒若不能磨短，就會長的過長，“咬合不正”就產生了。
2.齒根膿腫:齒冠過長會嚴重妨礙寵物兔進食。過長的門齒會刺傷嘴唇，過長的上臼齒會刺進面頰，過長的下臼齒會刺傷舌頭，兔兔會因疼痛而停止進食，同時口腔黏膜破損而造成潰爛。
更糟糕的是牙根也會生長，是向內牙根過長還會刺到鼻腔及眼球后面，嚴重的造成眼球突出或眼睛至鼻子中間部位出現膿包，下臼齒的牙根過長則是刺到下顎骨，面部膿包至此開始。所以寵物兔需要定期檢查牙齒生長情況，盡早發現問題，及時處理，平時也要盡量給干草類食物讓兔子多磨牙。
