松鼠約于每年春季1、2月發情，發情期大約為兩個星期左右。松鼠繁殖開始的適齡期，雌性為8～9周齡，雄鼠為9～10周齡。對松鼠來說，秋季也有一個發情期。在非繁殖季節，雌雄性成體分別占據一定的地方作為自己生活的活動范圍。
在野外，雌性保護一定面積的地盤是為了保護食物，其內不允許其他同種個體進入，對雄性個體也是如此。但是在繁殖季節，則明顯地放松對領域范圍的保護，允許雄性個體進入。
發情時，雌性個體食欲下降、活動加強，煩躁不安，呈興奮狀態;有時舔外陰部，且排尿頻繁，并發出尖尖的叫聲，允許雄性個體的靠近;此時陰門顏色變深且紅腫，有時有白色或微黃色粘液或凝乳狀的分泌物流出。在人工飼養條件下進行繁殖時，一定要挑選體格健壯，毛色光澤佳，精神狀況好，食欲旺盛的個體。
對雄性個體則要求性欲旺盛配種能力強;而對雌性則要求母性強，胎產數多，泌乳量充足的個體。配種時以一雄一雌或一雄多雌的交配方式，松鼠懷孕的時間大約為35～40天，4月初進入哺乳期，每年能產仔3次左右，每次能產4～6只。只要食物充足，松鼠的雌性個體就能繁殖較多個體，有著較強的繁殖力。
初出生的幼仔以母體乳汁作為全部營養需求的來源，因此，此時應該要特別注意母體的營養狀況，小松鼠剛生下時很小，看不見東西，發育很慢，生下將近30天時才睜開眼睛;至一個半月時，小松鼠才愿意到室外進行活動在小松鼠眼睛將開未開時，抱離母松鼠飼養，會與人變得親密。最初以吸管喂食熱牛奶(30-40°C)，每日3-5次。逐漸改為浸泡牛奶的面包或其他柔軟的食物。
